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Responsable : Jacqueline Cherfils
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L’objectif de nos recherches est de comprendre les réactions moléculaires qui gouvernent les fonctions des petites GTPases des familles Arf, Rab et Rho dans le trafic cellulaire et la dynamique du cytosquelette chez les cellules normales et malades. Les mécanismes de régulation de ces protéines, qui sont des interrupteurs moléculaires ubiquitaires chez les eucaryotes, émergent actuellement comme des cibles thérapeutiques, en particulier dans les cancers. Nous étudions ces protéines au moyen d’une panoplie de méthodes de biochimie structurale et cellulaire, qui nous permettent de les observer à l’échelle des atomes, d’analyser leurs interactions avec d’autres protéines et avec les membranes, d’identifier leurs spécificités, et de décrypter leurs mécanismes de régulation. Nos résultats récents ont porté en particulier sur l’activation des petites GTPases de la famille Arf par des facteurs d’échange GDP/GTP impliqués dans les cancers et dans les infections, et sur leur inhibition par des petites molécules chimiques.
Savoir-faire
- Production de protéines recombinantes : clonage, mutagenèse dirigée, production (E. coli et cellules d’insecte) et chromatographie
- Biophysique des protéines : dichroïsme circulaire, diffusion de la lumière, SEC-MALS
- Structure de complexes de protéines : cristallisation, cristallographie, small angle X-ray scattering (SAXS), analyse de structures
- Interactions protéine-protéine : chromatographie, anisotropie de fluorescence, SEC-MALS, microscale thermophoresis, calorimérie
- Interactions protéines-membranes : manipulation de liposomes, spectroscopies de fluorescence
- Mécanismes réactionnels : cinétiques de fluorescence
- Caractérisation d’inhibiteurs : spectroscopies de fluorescence, analyse en microplaques
- Biologie cellulaire : cultures de cellules de mammifères, immunofluorescence, microscopie confocale
Sélection de publications
Campanacci V, Mukherjee S, Roy CR, Cherfils J. Structure of the Legionella effector AnkX reveals the mechanism of phosphocholine transfer by the FIC domain. EMBO J (2013) accepted
Cherfils J, Zeghouf M. Regulation of Small GTPases by GEFs, GAPs, and GDIs. Physiol Rev. (2013) 93:269-309. (le PDF est téléchargeable sur nore page en anglais ICI)
Alix E., Chesnel L., Bowzard B.J., Tucker A.M., Delprato A., Cherfils J., Wood D.O, Kahn R.A. and Roy C.R. The capping domain in RalF regulates effector functions. PLoS Pathog. (2012) Nov;8(11):e1003012.
Vigil, D, Cherfils J, Rossman KL and Der CJ. Ras family GEFs and GAPs: validated and tractable targets for cancer therapy. Nature Reviews Cancer 2010, 10, 842-857.
Biou V, Aizel K, Roblin P, Thureau A, Jacquet E, Hansson S, Guibert B, Guittet E, van Heijenoort C, Zeghouf M, Perez J, Cherfils J. SAXS and X-ray Crystallography Suggest an Unfolding Model for the GDP/GTP Conformational Switch of the Small GTPase Arf6. J Mol Biol. 2010 Oct 1;402(4):696-707
Ramaen, O., A. Joubert, P. Simister, N. Belgareh-Touze, M.C. Olivares-Sanchez, J.C. Zeeh, S. Chantalat, M.P. Golinelli-Cohen, C.L. Jackson, V. Biou, and J. Cherfils, Interactions between conserved domains within homodimers in the BIG1, BIG2, and GBF1 Arf guanine nucleotide exchange factors. J Biol Chem, 2007. 282(39): p. 28834-42.
Pommier, Y. and J. Cherfils, Interfacial inhibition of macromolecular interactions: nature's paradigm for drug discovery. Trends Pharmacol Sci, 2005. 26(3): p. 138-45.
Pasqualato, S., F. Senic-Matuglia, L. Renault, B. Goud, J. Salamero, and J. Cherfils, The structural GDP/GTP cycle of Rab11 reveals a novel interface involved in the dynamics of recycling endosomes. J Biol Chem, 2004. 279(12): p. 11480-8.
Renault, L., B. Guibert, and J. Cherfils, Structural snapshots of the mechanism and inhibition of a guanine nucleotide exchange factor. Nature, 2003. 426(6966): p. 525-30. Cité dans faculty of 1000.
Ménétrey, J., E. Macia, S. Pasqualato, M. Franco, and J. Cherfils, Structure of Arf6-GDP suggests a basis for guanine nucleotide exchange factors specificity. Nat Struct Biol, 2000. 7(6): p. 466-9.
Cherfils, J., J. Ménétrey, M. Mathieu, G. Le Bras, S. Robineau, S. Béraud-Dufour, B. Antonny, and P. Chardin, Structure of the Sec7 domain of the Arf exchange factor ARNO. Nature, 1998. 392(6671): p. 101-5.
Financements
- Agence Nationale de la Recherche (ANR Blanc)
- Institut National du Cancer (INCa)
- Cancéropôle Île-de-France
- IFR115
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