|
Responsable : Solange Moréra
Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir.
Thématique
Notre équipe s’intéresse à élucider les mécanismes d’action d’enzymes seules ou au sein d’assemblages multimoléculaires. Nos travaux permettent de fournir les bases fondamentales décrivant le fonctionnement moléculaire de l’enzyme. Ils conduiront à l’élaboration de nouveaux agents antimicrobiens ou nouveaux anticancéreux (drug design) pour nos enzymes d’intérêt considérées comme de potentielles cibles thérapeutiques. Notre équipe possède une forte expertise en analyse structurale par cristallographie de mécanismes enzymatiques comme le transfert de phosphate et de sucre. Nous sommes aussi spécialisés dans l’étude des interactions protéine-protéine, protéine-ADN et protéine-ligand qui sont au centre des processus biologiques qui nous intéressent.
Nos principales thématiques portent sur :
- Des protéines bactériennes ou virales impliquées principalement dans des interactions hôtes-pathogènes.
- Le chaperon moléculaire Hsp90 et sa machinerie à travers l’étude d’inhibiteurs d’Hsp90, de protéines cibles d’Hsp90 et enfin du complexe R2TP formés de deux hélicases et de deux co-chaperons d’Hsp90.
- Des enzymes de modification ou réparation de l’ADN utilisant le retournement de base.
Approche expérimentale
Nous utilisons la cristallographie des protéines pour déterminer la structure 3D des protéines et analyser leur fonctionnement, seule ou dans les assemblages multimoléculaires où s’exerce leur activité cellulaire. L’analyse structure-fonction est complétée par des études biochimiques et biophysiques en solution. Les techniques couramment utilisées sont :
- Production des protéines (Clonage, Mutagénèse dirigée, Culture bactérienne…)
- Purification des protéines recombinantes (Chromatographie d’affinité, Gel filtration…)
- Tests enzymatiques et mesures d’inhibition (Spectrophotométrie)
- Cristallisation, cristallographie aux rayons X et analyse structurale
- Mesures d’interactions (Microcalorimétrie, Fluorescence, BIAcore)
- Analyses conformationnelles (Dichroïsme circulaire, Ultracentrifugation, Diffusion de lumière…)
- Analyse des modifications post-traductionnelles (Spectrométrie de masse)
- Bioinformatique et Modélisation moléculaire
Soutiens financiers
Association pour la Recherche sur le Cancer (ARC), Association Egide, Agence Nationale de la Recherche (ANR), Région Ile-de-France.
Collaborations actuelles
- Tyrosine-kinases bactériennes atypiques :
Christophe Grangeasse (IBCP, Lyon) ; Ivan Mijakovic (Institut Micalis, Thiverval-Grignon) ; Marie-Françoise Noirot-Gros (Institut Micalis, Jouy en Josas)
- Régulateurs du quorum-sensing chez B. cereus :
Didier Lereclus (GME, Guyancourt) ; Josef Deutscher (MGM, Thiverval-Grignon)
- Effecteurs du T3SS de Salmonella-protéines cibles humaines :
Francisco Ramos-Morales (Dpt de génétique, Université de Séville, Espagne)
- Machinerie Hsp90 :
Marc Billaud (Institut Albert Bonniot, Grenoble) ; Edouard Bertrand (IGM, Montpellier) ; Christiane Branlant/Bruno Charpentier (MAEM, Nancy) ; Sarah Sanglier (LSMBO, Strasbourg)
- Protéines périplasmiques bactériennes :
Denis Faure (ISV, Gif-sur-Yvette)
- Enzymes de réparation ou modification de l’ADN :
Murat Saparbaev (IGR, Villejuif) ; Saulius Klimasauskas (Vilnius, Lituanie)
Partenaire Techniques
Synchrotron SOLEIL, European Synchrotron Radiiation Facility (ESRF), IMAGIF
Rattachements
Ecole Doctorale 425 (Université Paris-Sud 11) : Innovation Thérapeutique: du fondamental à l'appliqué
IFR 115(CNRS, Université paris-Sud 11, Institut Curie) : Génomes, Transcriptomes, Protéomes
|