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Microbiologie et enzymologie structurales

 

Responsable : Solange Moréra Cette adresse email est protégée contre les robots des spammeurs, vous devez activer Javascript pour la voir.

Thématique

Notre équipe s’intéresse à élucider les mécanismes d’action d’enzymes seules ou au sein d’assemblages multimoléculaires. Nos travaux permettent de fournir les bases fondamentales décrivant le fonctionnement moléculaire de l’enzyme. Ils conduiront à l’élaboration de nouveaux agents antimicrobiens ou nouveaux anticancéreux (drug design) pour nos enzymes d’intérêt considérées comme de potentielles cibles thérapeutiques. Notre équipe possède une forte expertise en analyse structurale par cristallographie de mécanismes enzymatiques comme le transfert de phosphate et de sucre. Nous sommes aussi spécialisés dans l’étude des interactions protéine-protéine, protéine-ADN et protéine-ligand qui sont au centre des processus biologiques qui nous intéressent.

Nos principales thématiques portent sur :

  • Des protéines bactériennes impliquées principalement dans des interactions hôtes-pathogènes.
  • Des enzymes de modification ou réparation de l’ADN utilisant le retournement de base.
  • Le chaperon moléculaire Hsp90 et sa machinerie à travers l’étude du complexe R2TP formés de deux hélicases et de deux co-chaperons d’Hsp90.


Approche expérimentale

Nous utilisons la cristallographie des protéines pour déterminer la structure 3D des protéines et analyser leur fonctionnement, seule ou dans les assemblages multimoléculaires où s’exerce leur activité cellulaire. L’analyse structure-fonction est complétée par des études biochimiques et biophysiques en solution. Les techniques couramment utilisées sont :

  • Production des protéines (Clonage, Mutagénèse dirigée, Culture bactérienne…)
  • Purification des protéines recombinantes (Chromatographie d’affinité, Gel filtration…)
  • Tests enzymatiques et mesures d’inhibition (Spectrophotométrie)
  • Cristallisation, cristallographie aux rayons X et analyse structurale
  • Mesures d’interactions  (Microcalorimétrie, Fluorescence, BIAcore)
  • Analyses conformationnelles (Dichroïsme circulaire, Ultracentrifugation, Diffusion de lumière…)
  • Analyse des modifications post-traductionnelles (Spectrométrie de masse)
  • Bioinformatique et Modélisation moléculaire

 

Soutiens financiers

Association pour la Recherche sur le Cancer (ARC),  Association Egide, Agence Nationale de la Recherche (ANR), Région Ile-de-France.

 

Collaborations actuelles

  • Protéines périplasmiques bactériennes :
    Denis Faure (ISV, Gif-sur-Yvette), Yves Queneau (ENS, Lyon), John Reader (USA)
  • Hsp90-R2TP :
    Edouard Bertrand  (IGM, Montpellier) ;  Christiane Branlant/Bruno Charpentier (MAEM, Nancy) ; Sarah Sanglier (LSMBO, Strasbourg) ; Philippe Meyer (IBPC, Paris)
  • Enzymes de réparation ou modification de l’ADN :
    Murat Saparbaev (IGR, Villejuif) ; Saulius Klimasauskas (Vilnius, Lituanie)

 

Partenaire Techniques

Synchrotron SOLEIL, European Synchrotron Radiiation Facility (ESRF), IMAGIF

 

Rattachements

Ecole Doctorale 425 (Université Paris-Sud 11) : Innovation Thérapeutique: du fondamental à l'appliqué

IFR 115(CNRS, Université paris-Sud 11, Institut Curie) : Génomes, Transcriptomes, Protéomes

 

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